被各国联系统治的中世纪的神州·日本。在那上空中由八艘船组成的都市舰“武藏”飞行着……在悠远的未来。经过了“重奏统合争乱”，并把联繫着人类的命运的“圣谱”作为原本历史的再现而执行的各国。然后，是各式各样把迷惑与决意藏于胸口，行进开拓着未来的人们。把相互重合的中世纪世界作为舞台，先生们在学园国度间的抗争正式演出了！

　　在暑假完毕後的第一天，一名由于不测而回到过去的大佐基利亚共和国驾驶员，对渡瀬青叶展开了袭击。弓原雏为了维护渡瀬青叶，也乘上了自己的机体，与朋友展停战役。但最后两人却由于又一次的不测，离开了未来的世界。在转移进程中，弓原雏只留下了“迪奥正在等你”的讯息，就随即消逝了……

　　渡濑青叶（松冈祯丞 配音）就读于诚应高校，是一名伟大的高中生。青叶拥有着冷静冷静的性情和强壮机敏的体魄，是冤家们眼中牢靠的存在。某日，青叶居然遭到了一架奇特机体的猛烈攻击，就在这个节骨眼上，另一架机体即使出现，挽救了青叶。　　救了青叶的是名叫弓原雏（早见沙织 配音）的少女，外表上看来她不过是青叶的同班同窗，可实践上，雏来自于未来，专程为了维护青叶而潜伏在他的身边。一场不测将青叶和雏带往了未来世