在睡梦中，大空看到很奇异的现象，但一醒悟来，却发现自己要迟到了······于是大空骑车飞奔回校，不幸吃了一球，和萩原大介撞在一同······幸得麻衣子相救，大空才躲过被揍的厄运。教室里，麻衣子经过威逼和威吓，逼使大空放学跟她一同走······放学后，麻衣子为了让大空改掉前功尽弃的坏习气，带了他到龙宫城的地下游戏中心。在惊讶和兴奋之余大空跟麻衣子去注册，并“挑选”（电脑依据团体资料选择）了一条“

　　一天，大雄和静儿、技安被强夫邀到家中观赏恐龙化石。当然，大雄免不了又被强夫取笑一番。为了要做强夫面前争一口吻，大雄夸下海口，恐龙化石没什么了不起，他要让小同伴们见识一下真正的恐龙！　　奇观再次发作在大雄身上，他真的找到了一颗活的恐龙蛋！大雄和叮当在家将小恐龙孵化了出来并在公园里暗中饲养。小恐龙比助一天天长大，公园有怪兽的音讯传遍了日本。为了小恐龙能安康生长，大家决议将小恐龙用光阴机送回白垩纪。

　　大雄最近有点儿倒运，在学校由于功课被教员痛斥，打棒球技术差被同伴们讪笑，房间太乱遭到妈妈责骂。伤心的他想入非非，希望有某种魔法能帮他搞定这一切。在哆啦A梦的“假设电话亭”的协助下，他们的世界变成了一个魔法的世界，不幸的是大雄依然是最差的那个。　　与此同时，奥秘天体正在接近 地球，魔界之王戴玛奥希图统治世界，他预测到大雄和他的冤家们将是他行进路途上的阻碍，于是他派出魔女美杜沙根除这些绊脚石。大雄

乌黑的夜晚，一名特务悄然潜入日本警方某机构，盗走了记载着各国谍报机构重要数据的绝密文件的绝密数据。日本警方和FBI探员赤井秀一（池田秀一 配音）旋即与特务展开追逐。最后，逃亡者的车辆坠落悬崖。第二天，柯南（平地南 配音）和同伴们离开东都水族馆观光，结果发现一名受伤的美丽女子（天海佑希 配音）。该女子处于失忆形状，身上的手机也破损无法运用。柯南等人容许要帮她恢复记忆，当他们众说纷纭之际，藏在暗处的黑